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腺苷（A）與肌苷（I）RNA編輯在癌癥轉(zhuǎn)錄組中可實(shí)現(xiàn)許多核苷酸的改變。 然而，由于轉(zhuǎn)錄后調(diào)控的復(fù)雜性，RNA編輯對(duì)人類(lèi)癌癥中蛋白質(zhì)組多樣性的貢獻(xiàn)仍不清楚。 在這里，研究人員對(duì)TCGA基因組數(shù)據(jù)和CPTAC蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)進(jìn)行了綜合分析。
盡管存在有限的位點(diǎn)多樣性，科研人員證明A到I RNA編輯通過(guò)改變氨基酸序列有助于增大乳腺癌中的蛋白質(zhì)組多樣性。 我其驗(yàn)證了RNA和蛋白質(zhì)水平的編輯的可實(shí)用性。 編輯的COPA蛋白在體外增加癌細(xì)胞的增殖，遷移和侵入。 該研究表明A-to-I RNA編輯對(duì)癌癥蛋白質(zhì)多樣性的重要貢獻(xiàn)，并突出其翻譯潛力。
腺苷（A）到肌苷（I）RNA編輯是人類(lèi)中zui普遍的RNA編輯機(jī)制，其中ADAR酶在選擇性轉(zhuǎn)錄物的特定核苷酸位點(diǎn)處將A轉(zhuǎn)變?yōu)镮而不影響DNA序列同一性。盡管廣闊大多數(shù)A到I編輯發(fā)生在非編碼區(qū)域，但有趣的是已經(jīng)報(bào)道了幾種單獨(dú)RNA編輯在腫瘤發(fā)生中發(fā)揮關(guān)鍵作用，例如肝癌中的AZIN1編輯，膠質(zhì)母細(xì)胞瘤中的CDC14B編輯，RHOQ編輯在結(jié)腸直腸癌，SLC22A3和IGFBP7在食管癌中的編輯，胃癌中的PODXL編輯和乳腺癌中的GABRA3編輯。
RNA編輯與蛋白表達(dá)
使用來(lái)自癌癥基因組圖譜（TCGA）的RNA測(cè)序（RNA-seq）數(shù)據(jù)，zui近的研究已經(jīng)在癌癥轉(zhuǎn)錄組中檢測(cè)到大量的A至I編輯的實(shí)現(xiàn)，其中許多有臨床相關(guān)性。然而，人類(lèi)癌癥RNA編輯模式的研究到目前為止僅集中在RNA水平上。鑒于轉(zhuǎn)錄后調(diào)控的巨大復(fù)雜性，研究人員旨在解決由錯(cuò)義A到I編輯所產(chǎn)生的遺傳信息被翻譯成蛋白質(zhì)序列的程度，從而有助于癌癥蛋白質(zhì)組學(xué)的多樣性。zui近從臨床蛋白質(zhì)組腫瘤分析聯(lián)盟（CPTAC）獲得的質(zhì)譜（MS）數(shù)據(jù)提供了解決這個(gè)問(wèn)題的機(jī)會(huì)，因?yàn)樗鼈兪菑幕颊邩悠樊a(chǎn)生的具有來(lái)自TCGA的平行基因組和轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的隊(duì)列。
了解促成癌細(xì)胞蛋白質(zhì)多樣性的機(jī)制是癌癥研究中的一個(gè)基本問(wèn)題，因?yàn)橥蛔兊鞍滓驯粡V泛用作生物標(biāo)志物和治療靶點(diǎn)，并且zui近的研究將其作為癌癥免疫療法的主要決定因素。這項(xiàng)研究提供了大規(guī)模的直接證據(jù)，表明在癌癥中A到I RNA編輯的技術(shù)可明顯提高蛋白質(zhì)多樣性的表達(dá)水平。
雖然從蛋白質(zhì)水平檢測(cè)到的DNA突變和通過(guò)RNA編輯的突變位點(diǎn)數(shù)量較低，但研究人員的分析提供了對(duì)這兩種機(jī)制對(duì)癌癥蛋白質(zhì)多樣性的較為詳細(xì)的闡述。在所調(diào)查的三種癌癥類(lèi)型中，RNA編輯對(duì)癌癥蛋白質(zhì)組多樣性的貢獻(xiàn)在BRCA中zui顯著。即使就變異肽的*變體而言，RNA編輯的貢獻(xiàn)也是值得注意的。事實(shí)上，根據(jù)特定位點(diǎn)的平均覆蓋率，改變蛋白質(zhì)序列的RNA編輯位點(diǎn)的實(shí)際數(shù)量可能是該研究中確定的10-100倍。然而，RNA編輯的水平因細(xì)胞而異，通常低于體細(xì)胞突變。
已明確的A到I編輯可實(shí)現(xiàn)的變應(yīng)肽
在以前的研究中報(bào)道的COG3和COPA可以功能性地驅(qū)動(dòng)癌細(xì)胞的生長(zhǎng)和遷移，類(lèi)似于驅(qū)動(dòng)體細(xì)胞突變。總的來(lái)說(shuō)，該研究表明，A至I RNA編輯至少在某些癌癥類(lèi)型中有助于蛋白質(zhì)異質(zhì)性，因此值得癌癥研究界去闡明人類(lèi)癌癥的分子基礎(chǔ)并開(kāi)發(fā)預(yù)后和治療方法。相信在不久的未來(lái)，利用RNA編輯技術(shù)與PD-L1聯(lián)合抗癌會(huì)取得不錯(cuò)的治療效果。
參考文獻(xiàn)
Xinxin Peng, Xiaoyan Xu,Yumeng Wang. A-to-I RNA Editing Contributes to Proteomic Diversity in Cancer
13916499749
